Научные статьи // Новые ферменты
Новая метилзависимая сайт-специфическая эндонуклеаза KroI узнаёт и расщепляет последовательность ДНК 5'-G^C(5mC)GGC-3'
- Категория: Новые ферменты
- Просмотров: 7876
Вестник биотехнологии и физико-химической биологии имени Ю. А. Овчинникова. – 2011. – Т. 7 – № 1 – С. 14 - 20
Выделена новая 5-метилцитозин-зависимая сайт-специфическая ДНК эндонуклеаза KroI из Kocuria rosea 307, узнающая и расщепляющая последовательность ДНК 5'-G↑CCGGC-3'/3'-CGGCC↑G-5' при наличии в центральном динуклеотиде и его комплементе 5'-CG-3'/3'-GC-5' одного или двух 5-метилцитозинов. КroI не гидролизует неметилированную ДНК, а также метилированные последовательности 5'-G(5mC)CGGC-3'/3'-CGGC(5mC)G-5' и 5'-G(5mC)CGG(5mC)-3'/3'-(5mC)GGC(5mC)G-5'. KroI является первой сайт-специфической метилзависимой эндонуклеазой, узнающей невырожденную шестинуклеотидную последовательность. Благодаря своей способности расщеплять только метилированную ДНК фермент KroI может найти практическое применение в молекулярно-биологических работах, в частности, для определения статуса метилирования ДНК эукариот.
Подробнее: Новая метилзависимая сайт-специфическая эндонуклеаза KroI узнаёт и расщепляет...
Новая эндонуклеаза рестрикции AluBI из Arthrobacter luteus B- изошизомер AluI, нечувствительный к присутствию 5-метилцитозина в сайте узнавания AGCT
- Категория: Новые ферменты
- Просмотров: 7108
Вестник биотехнологии и физико-химической биологии имени Ю. А. Овчинникова. – 2007. – Т. 3 №1. – С. 21-27
Описаны свойства новой эндонуклеазы рестрикции, AluBI, узнающей и расщепляющей последовательность AGCT и являющейся изошизомером хорошо известной рестриктазы AluI. Фермент AluBI, в отличие от AluI, расщепляет ДНК в случае, когда цитозиновые основания в сайте узнавания метилированы в положение С5. AluBI также расщепляет последовательность узнавания с одним С5-метилированным и другим N4-метилированным цитозинами, однако не расщепляет ДНК при модификации обоих цитозинов в положение N4.
Новая сайт-специфическая эндонуклеаза GluI узнает метилированную последовательность ДНК 5’-G(5mC)^NG(5mC)-3’/ 3’-(5mC)GN^(5mC)G-5’
- Категория: Новые ферменты
- Просмотров: 5918
Вестник биотехнологии и физико-химической биологии имени Ю. А. Овчинникова, 2007, Т. 3, №2, с. 13-17
Из бактериального штамма Glacial ice bacterium GL24 была выделена и охарактеризована новая сайт-специфическая эндонуклеаза GluI. Этот фермент узнает метилированную последовательность ДНК 5’-G(5mC)^NG(5mC)-3’/3’-(5mC)GN^(5mC)G-5’ расщепляет ее, как указано стрелкой. Благодаря своей способности расщеплять только высокометилированную ДНК фермент GluI может найти практическое применение в генно-инженерных работах, а также для определения статуса метилирования ДНК эукариот.
Сайт-специфическая эндонуклеаза BlsI узнает последовательность ДНК 5’-G(5mC)N^GC-3’ и расщепляет ее с образованием 3’-выступающих концов
- Категория: Новые ферменты
- Просмотров: 6561
Вестник биотехнологии и физико-химической биологии имени Ю. А. Овчинникова, 2007, т. 3, №1, с. 28-33
Из природных изолятов выделен бактериальный штамм Bacillus simplex 23, продуцент сайт-специфической эндонуклеазы BlsI. Этот фермент узнает метилированную последовательность ДНК 5’-G(5mC)N↑GC-3’, как и обнаруженная ранее сайт-специфическая эндонуклеаза BisI (сайт узнавания 5’-G(5mC)↑NGC-3’), но, в отличие от последней, расщепляет ДНК с образованием однонуклеотидных 3’-выступающих концов. Благодаря своей способности расщеплять только метилированную ДНК фермент BlsI может найти практическое применение в генно-инженерных работах, а также для определения статуса метилирования ДНК эукариот.
Новая сайт-специфическая эндонуклеаза AbsI из Arthrobacter species 7М06 узнает октануклеотидную палиндромную последовательность ДНК 5’-CC^TCGAGG-3’
- Категория: Новые ферменты
- Просмотров: 6767
Вестник биотехнологии и физико-химической биологии имени Ю. А. Овчинникова, 2006, т. 2, №2, с. 29-34
Обнаружен бактериальный штамм Arthrobacter species 7М06, который является продуцентом новой сайт-специфической эндонуклеазы AbsI. Фермент AbsI узнает палиндромную октануклеотидную последовательность ДНК 5’-CC^TCGAGG-3’ и гидролизует ее после второго цитозина, образуя, таким образом, 5’-выступающие «липкие» концы, которые совместимы с концами, образующимися при гидролизе ДНК эндонуклеазами рестрикции XhoI (5’-C^TCGAG-3’), PspXI (5’-VC^TCGAGB-3’) и SalI (5’-G^TCGAC-3’). Среди всех известных редкощепящих эндонуклеаз рестрикции AbsI является единственным ферментом, не имеющим сайтов узнавания на стандартных субстратов, таких как ДНК фагов лямбда и Т7, а также аденовирусной ДНК типа 2.
Еще статьи...
- Новая эндонуклеаза рестрикции GlaI узнает метилированную последовательность 5’-G(5mC)^GC-3’.
- Новая эндонуклеаза рестрикции Bis I из Bacillus subtilis Т30 узнаёт метилированную последовательность ДНК 5’-G(5mC)↓NGC-3’
- Термолабильная щелочная фосфатаза из психрофильного микроорганизма Alteromonas undina P2
- Новая эндонуклеаза рестрикции PspXI узнает необычную последовательность ДНК 5’-VC^TCGAGB-3’