Главная  //  Научные статьи  //  Новые ферменты

Новая эндонуклеаза рестрикции GlaI узнает метилированную последовательность 5’-G(5mC)^GC-3’.

Чернухин В.А., Наякшина Т.Н., Абдурашитов М.А., Томилова Ю.Э., Мезенцева Н.В., Дедков В.С., Михненкова Н.А., Гончар Д.А., Дегтярев С.Х

Биотехнология, 2006, № 4, С.31-35

 

Из бактериального штамма GL29 была выделена и охарактеризована новая эндонуклеаза рестрикции GlaI. Этот фермент узнает метилированную последовательность ДНК 5’-G(5mC)↓GC-3’ и расщепляет ее, как указано стрелкой. Благодаря своей способности расщеплять только метилированную ДНК GlaI может найти практическое применение в генно-инженерных работах, а также для определения статуса метилирования ДНК эукариот.

Читать полный текст статьи Новая эндонуклеаза рестрикции GlaI узнает метилированную последовательность 5’-G(5mC)^GC-3’.

Новая эндонуклеаза рестрикции Bis I из Bacillus subtilis Т30 узнаёт метилированную последовательность ДНК 5’-G(5mC)↓NGC-3’

Е.В. Чмуж, Ю.Г. Каширина, Ю.Э. Томилова, Н.В. Мезенцева, В.С. Дедков, Д.А. Гончар, М.А. Абдурашитов, С.Х. Дегтярев*

Биотехнология, 2005, № 3, С. 22-26.

 

Из природных изолятов выделен бактериальный штамм Bacillus subtilis Т30, продуцент новой эндонуклеазы рестрикции Bis I. Этот фермент узнает метилированную последовательность ДНК 5’-G(5mC)↓NGC-3’ и расщепляет ее, как указано стрелкой. Вследствие расщепления только модифицированной ДНК, фермент Bis I может найти широкое применение для определения метилированных участков на эукариотической ДНК.

Читать полный текст статьи Новая эндонуклеаза рестрикции Bis I из Bacillus subtilis Т30 узнаёт метилированную...

Новая эндонуклеаза рестрикции PspXI узнает необычную последовательность ДНК 5’-VC^TCGAGB-3’

Д.А. Гончар, М.А. Абдурашитов, О.А. Беличенко, В.С. Дедков, Н.В. Мезенцева, Ю.Э. Томилова, С.Х. Дегтярев.

Вестник биотехнологии, 2005, 1, №1, с. 18-23.

 

Нами обнаружен бактериальный штамм Pseudomonas species X11, который является продуцентом новой эндонуклеазы рестрикции, названной PspXI. Этот фермент узнает восьминуклеотидную последовательность ДНК с необычным, V-B типом вырожденности: 5’-VCTCGAGB-3’, где V означает A, C или G, а B означает T, C или G. Препарат эндонуклеазы рестрикции PspXI с концентрацией 10000 ед/мл был получен путем очистки в четыре хроматографические стадии. Показано, что PspXI гидролизует сайт узнавания между C и T, с образованием 5’-выступающих “липких” концов, совместимых с концами, образующимися при гидролизе ДНК эндонуклеазами рестрикции XhoI (5’-C^TCGAG-3’) и SalI (5’-G^TCGAC-3’).

Читать полный текст статьи Новая эндонуклеаза рестрикции PspXI узнает необычную последовательность ДНК 5’-VC^TCGAGB-3’

Термолабильная щелочная фосфатаза из психрофильного микроорганизма Alteromonas undina P2

Ю.П. Зернов, В.С. Дедков, Ю.А. Антонова, Н.А. Михненкова, С.Х. Дегтярев

Биотехнология, 2005, № 2, с. 38-43

 

Из природных изолятов нами был выделен продуцент термолабильной щелочной фосфатазы, идентифицированной как вид бактерии Alteromonas undina P2. Описан способ очистки фермента. Определены оптимальные условия действия щелочной фосфатазы: 0.1 М глицин-NaOH pH 9.5, 10 мМ MgCl2 и 0.1 мМ ZnCl2. Фермент наиболее активен при 30°C. При 6°C уровень активности щелочной фосфатазы превышает 50% от максимальной. Прогревание ферментного препарата в течение 20 мин при 65° приводит к полной необратимой инактивации фосфатазы.

Читать полный текст статьи Термолабильная щелочная фосфатаза из психрофильного микроорганизма Alteromonas undina P2

Эндонуклеаза рестрикции AjnI из Acinetobacter johnsonii R2 — изошизомер EcoRII, узнаёт 5’-^CCWGG-3’, но не блокируется dcm-метилированием

В.С. Дедков*, Н.А. Михненкова, Л.П. Власенко, Ю.Э. Томилова, Ю.Г. Каширина, Д.А. Гончар, С.Х. Дегтярёв

Биотехнология, 2004, № 3, С. 19-24

 

Из природных изолятов был выделен новый продуцент эндонуклеазы рестрикции (рестриктазы), идентифицированный как вид Acinetobacter johnsonii R2, а его рестриктаза названа AjnI. Описан способ очистки и оценки активности фермента. Показано, что рестриктаза AjnI образует фрагменты ДНК с 5’-CCWGG выступающими концами, как и EcoRII, но не блокируется dcm-метилированием. Рестриктаза AjnI может найти широкое применение в генетической инженерии.

Читать полный текст статьи Эндонуклеаза рестрикции AjnI из Acinetobacter johnsonii R2 — изошизомер EcoRII, узнаёт...