Научные статьи // Клонирование генов систем рестрикции-модификации
Сравнительный анализ гомологичных систем рестрикции-модификации SfeI и LlaBI
- Категория: Клонирование генов систем рестрикции-модификации
- Просмотров: 11314
Молекулярная биология, 2002, том 36, № 3, с. 438-441
Клонирован фрагмент плазмидной ДНК Streptococcus faecalisSE72, содержащий гены системы рестрикции-модификации SfeI. Анализ нуклеотидной последовательности фрагмента выявил высокую гомологию между оперонами систем SfeI и LlaBI из Lactococcus lactis subsp. cremoris W56 (99.2%) с тем же участком узнавания 5-CTRYAG-3'. Существенными отличиями системы SfeI от LlaBI являются дополнительный фрагмент длиной 198 п.н. в гене ДНК-метилтрансферазы и большая длина гена предполагаемого контрольного белка. Отсутствие гомологии между нуклеотидными последовательностями, прилегающими к оперонам двух систем, свидетельствует о горизонтальном переносе оперонов между двумя близкими родами бактерий.
Подробнее: Сравнительный анализ гомологичных систем рестрикции-модификации SfeI и LlaBI
Множественность сайт-специфических ДНК-метилтрансфераз системы рестрикции-модификации BstF5I из Bacillus stearothermophilus F5
- Категория: Клонирование генов систем рестрикции-модификации
- Просмотров: 7325
Молекулярная биология, 2000, том 34, № 3, с. 443-47
Определена нуклеотидная последовательность фрагмента ДНК Bacillus stearothermophilus F5, прилегающего к 3'-концу области, содержащей гены ДНК-метилтрансфераз M.BstF5I-1 и M.BstF5I-2 из системы рестрикции-модификации BstF5I. Выявлен ген, кодирующий белок M.BstF5I-3, структурно и функционально гомологичный N-концевому домену метилазы M.FokI. Таким образом, в отличие от всех известных систем рестрикции-модификации, система BstF5I включает три гена, кодирующих ДНК-метилтрансферазы, две из которых гомологичны двум различным доменам M.FokI.
Вторая ДНК-метилтрансфераза из системы рестрикции-модификации BstF5I гомологична C-концевым доменам метилаз FokI и StsI
- Категория: Клонирование генов систем рестрикции-модификации
- Просмотров: 5808
Молекулярная Биология, 2000, том 34, № 1, с. 87-94
Определена нуклеотидная последовательность гена ДНК-метилтрансферазы М.BstF5I-2, входящей в систему рестрикции-модификации штамма Bacillus stearothermophilus F5. На бактериальной хромосоме ген bstF5IM-2 располагается за геном метилазы М.BstF5I-1 и имеет ту же ориентацию. Кодируемый геном bstF5IM-2 белок содержит консервативные участки, специфичные для адениновых ДНК-метилтрансфераз класса D12. ДНК-метилаза М.BstF5I-2 гомологична С-концевым доменам ДНК-метилаз FokI и StsI, имеющим ту же последовательность узнавания. Таким образом, система рестрикции-модификации BstF5I содержит уникальный фермент М.BstF5I-1, модифицирующий верхнюю цепь узнаваемой последовательности, и М.BstF5I-2, гомологичный С-концевым частям ферментов-изошизомеров М.FokI и М.StsI, модифицирующих вторую цепь ДНК в участке узнавания.